南通病毒载体整合位点报告

靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。基于已有科学经验和既往非临床/临床研究结果，如果认为基因修饰细胞所采用的载体系统可将外源基因整合到细胞基因组中并可在体内长期存续，需综合分析以上风险因素，评估潜在的插入突变、致瘤/致性风险。非临床研究，应采用具有代表性的基因转导细胞进行基因整合位点分析，分析细胞的克隆组成以及在关注基因（如liu相关调控基因）附近有无优先整合迹象，含有关注整合位点的细胞有无优先异常增殖。整合位点分析,基因和细胞的安全指南。南通病毒载体整合位点报告

申请人可以基于总体临床研究规划考虑早期探索性研究的设计，在早期研究中纳入有助于未来产品研发的设计要素，例如，在I期临床试验中设置有效性或体内药效学观察指标，以收集有效性的初步证据。申请人有时会考虑将早期研究设计为I期和II期合并进行的I/II期试验，在剂量递增和推荐剂量明确后，进入扩展期，以推荐的剂量水平继续入组额外的患者，进一步观察免疫细胞zhiliao产品的疗效。如果采用该类设计，在试验方案中应明确从剂量递增阶段转到扩展阶段的原则和方法。宁波AAV整合位点服务从细胞游离DNA中检测载体整合位点。

病人在6个月后达到MRD阴性，CAR-T细胞在4.2年后仍然可以在外周血检测到，并且骨髓中检测不到B细胞liu克隆。二代测序整合位点分析显示这是因为某些CAR-T细胞的融合位置位于TET2基因9号到10号外显子之间可变剪切区域，导致TET2基因跳读和功能障碍，从而产生短寿命记忆细胞扩增和长寿命记忆细胞。使得药物可以持久作用于病人。研究者继而进行插入位点和CAR-T细胞扩增及持续作用时间的相关研究，利用慢病毒插入位点信息（INSPIIRED）和LASSO logistic 回归模型进行插入位置和药效学分析，初步建立预测模型。研究者还建议在CAR-T产品回输前进行类似的多变量预测可以对产品的安全性和有效性进行更为有效的评估。

2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化（成瘤性和致瘤性）进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则（试行）》中规定：探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变，导致成瘤性和恶性转化等"。采用LM-PCR和全基因组重测序两种方法,可以有效分析重组细胞外源序列的整合位点。

生殖毒性基因zhiliao产品应根据受试物的产品类型、作用机制、一般毒理发现、生物分布特征以及患者人群来评估潜在的生殖/发育毒性风险。生殖毒性试验的研究策略和风险评估可参考ICHS5（R3）的建议和ICHM3（R2）、S6及S9中的相关内容。通常需要开展胚胎-胎仔发育毒性和围产期毒性研究，除非有基于具体产品类型的特殊考虑并具有科学合理性。如果基因zhiliao产品拟用于有生育可能或妊娠人群，应研究产品对胎儿的影响（例如细胞因子局部生成后通过胎盘转运），开展胚胎-胎仔发育和围产期毒性试验。如果在一般毒理学试验中发现有潜在的生殖qiguan毒性反应，应开展生育力和早期胚胎发育毒性试验。转基因植物外源基因的检测方法及整合位点分析。宁波AAV整合位点服务

对T细胞受体(TCR)β链库进行深度测序(TCR-seq)以及慢病毒载体整合位点(LVIS)分析。南通病毒载体整合位点报告

基因zhiliao产品特有的可能会引起迟发性不良反应的风险因素包括：基因组整合活性。基因zhiliao产品可能会采用修饰宿主基因组的技术，并有可能在宿主细胞或组织中持续存在。很多基因zhiliao载体的基因整合不会指向基因组的特定位点，可能在整合位点处产生插入突变、或jihuo整合位点附近的原基因等，进而破坏重要基因功能或增加恶性liu的风险，例如，国外已有多项研究报告在接受了使用γ-逆转录病毒载体转导的基因修饰细胞zhiliao的受试者中发生白血病。因此，对于存在此类风险的产品，有必要进行长期随访临床研究以评估出现迟发不良反应的风险。南通病毒载体整合位点报告