“免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的结合蛋白,进行小规模的蛋白质亲和纯化的实验。更确切地说,IP是采用固定在微珠支持物(一般是琼脂糖树脂)上的特定抗体,从复杂的混合物中,纯化单一抗原的实验。固定化蛋白质复合物的组装既可以分步进行,也可以一步完成。
常见的加样顺序:抗体和样本(如细胞裂解物)一起孵育,然后加入亲和微珠,用于捕获抗体-抗原复合物。也可以将抗体和微珠(通过抗体结合蛋白,如蛋白A、G或A/G等,直接或间接结合抗体)先进行孵育,然后再加入含有抗原的样本。当抗原、抗体和固相支持物产生结合以后,充分洗涤微珠,再采用适当的洗脱缓冲液从支持物上洗脱抗原。
免疫沉淀Co-IP抗体的选择?Protein AG免疫沉淀磁珠应用
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种强大的技术,用于研究蛋白质与DNA之间的相互作用,尤其是在转录调控、DNA修复、复制以及表观遗传学领域。然而,像所有实验技术一样,ChIP实验也有其优点和缺点。
ChIP实验的优点:
1. 体内反应的反映:ChIP提供了一种在体内研究蛋白质与DNA相互作用的方法,能够真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白的调控信息。
2. 全基因组覆盖:ChIP技术可以覆盖整个基因组,提供关于蛋白质-DNA相互作用的视图。
3. 适用于多种蛋白质:ChIP可以用来研究组蛋白修饰、转录因子以及其他DNA结合蛋白。
ChIP实验的缺点:
1. 实验步骤繁琐。
2. 需要大量起始材料:ChIP实验通常需要大量的细胞或组织作为起始材料。
3. 交联的影响:使用交联剂可能会改变蛋白质的结构,从而影响抗体的识别和蛋白质-DNA的相互作用。
4. 染色质碎裂的分辨率:染色质碎裂的效率和分辨率直接影响ChIP的准确性,需要优化以获得结果。
5. 抗体质量:抗体的质量对实验结果至关重要,但高质量、特异性强的抗体可能难以获得或成本较高。
杭州Co IP免疫沉淀磁珠价格免疫沉淀技术IP实验步骤。
免疫沉淀实验不同于WB实验的样品制备,对实验样品制备要求更高,除了要控制所有操作尽量在冰上完成外,关键的是裂解液的成分,裂解液成分直接决定了样品质量。
主要影响:
1. 蛋白的释放:许多目的蛋白定位在细胞器,质膜,细胞核,细胞骨架中,但通常这些亚细胞结构很难被裂解液有效溶解,所以很难将这些蛋白释放出来。
2. 蛋白相互作用:不同去垢剂对不同性质的蛋白质间相互作用影响程度不同,一些互作较弱的蛋白对尽管在比较温和的裂解液配方中仍然会被破坏。
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验设计概述:
1. 目标蛋白的选择:确定您想要研究的目标蛋白,例如特定的转录因子或组蛋白修饰。
2. 样本的准备:根据研究的需要选择合适的细胞或组织样本。
3. 抗体的选择:选择具有高特异性和亲和力的抗体,这对于实验的成功至关重要。
4. 交联:使用甲醛等交联剂将蛋白质与DNA在体内共价结合,形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
5. 细胞裂解:裂解细胞以释放染色质,同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
6. 染色质的剪切:通过超声或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段,通常在200-1000 bp之间。
7. 免疫沉淀:使用特定抗体与目标蛋白结合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀复合物。
8. 洗涤和洗脱:洗涤沉淀物以去除未特异性结合的蛋白质和DNA,然后洗脱目标蛋白-DNA复合物。
9. 逆转交联:使用蛋白酶K处理样品以逆转交联,释放DNA。
10. DNA的纯化和分析:纯化DNA并使用qPCR、芯片或测序技术(如ChIP-seq)进行分析。
免疫沉淀技术IP的应用有哪些?
免疫沉淀Co-IP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
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免疫沉淀技术RIP的实验设计。Protein AG免疫沉淀磁珠应用
RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的实验设计需要考虑多个方面,以确保实验的准确性和可重复性。
1. 目标蛋白的选择:确定你想要研究的目标RNA结合蛋白(RBP)。
2. 阳性和阴性对照:设计实验时,需要包括阳性对照和阴性对照。
3. 细胞培养与裂解:选择合适的细胞类型进行培养。
4. 抗体孵育:将特异性抗体与细胞裂解液孵育,以形成抗体-蛋白质-RNA复合物。
5. 免疫沉淀:使用蛋白A或蛋白G结合的珠子进行免疫沉淀,捕获抗体-蛋白质-RNA复合物。
6. 洗涤和分离:洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。从珠子上分离RNA,可能需要使用低pH缓冲液或蛋白酶K处理。
7. RNA分析:使用qPCR、Northern blot或RNA-Seq等方法分析沉淀下来的RNA。
8. 数据分析:对实验结果进行定量分析,比较不同样品之间的RNA水平。
9. 实验重复:为了确保结果的可靠性,实验应该进行至少三次重复。
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10. 技术验证:使用其他技术(如RNA-pull down或FISH)验证RIP实验结果。
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