AAV病毒滴度通常分为物理滴度和infection滴度。物理滴度一般是指基因组滴度或者衣壳滴度。在测定AAV的含量时,通常采用基因组滴度或者衣壳滴度作为单位,其中基因组滴度为携带基因组的AAV的浓度,衣壳滴度为AAV物理颗粒的浓度。基因组滴度一般采用qPCR、ddPCR、染料法、UV/Vis等方法来测定;衣壳滴度主要是通过ELISA、HPLC等方法来测定。AAV基因组滴度检测的关键在于尽可能彻底去除AAV衣壳外的HCD残留,减少污染核酸对qPCR或ddPCR的影响。经典方法是加入常规核酸酶(如Dnase I、Benzonase等)消化AAV衣壳外的HCD残留,然后加入Proteinase K破碎病毒衣壳,进行后续检测。经过对比发现,用SAN HQ高盐核酸酶替代常规核酸酶处理AAV病毒,能够更高效去除衣壳外的核酸残留,qPCR或ddPCR结果重复性更高、更稳定。SAN HQ高盐核酸酶在高盐浓度下活性更适,DNA去除效率更高。青海ArcticZymes高盐核酸酶70921-150
染色质由组蛋白和DNA组成,——147个碱基对的DNA缠绕在8个组蛋白(由H2A、H2B、H3和H4形成的八聚体)周围,形成基本的染色质单位,即核小体。核小体像珠串一样串连在一起,并被包装成更高阶的染色质结构。DNA带负电荷,富含碱性氨基酸的组蛋白带正电荷,且组蛋白多聚物有很多疏水区段。所有这些特点导致宿主DNA残留(HCD)能吸附很多物质,包括宿主蛋白残留(HCD)、色谱填料、目的病毒颗粒等,因此,HCD的存在增加了工艺流程的复杂度,同时也降低了病毒颗粒的稳定性。重庆高盐条件高盐核酸酶70921-160染色质的双螺旋结构影响DNA的检测与酶切处理。
一般来说,生物生产工艺用的核酸酶以BenzonaseTM(BenzonaseTM是Merck的注册商标)为主,能高效降解任何形式(双链、单链、线状、环状)的DNA和RNA。该酶来自于大自然界普遍存在的S.Marcescen,通过E.coli发酵生产得到。该酶的适宜反应条件是低盐浓度范围(<100mM盐浓度),且酶活随着盐浓度上升而下降,在300mM盐浓度时酶活几乎丧失。对于细胞基因药物常用的两种病毒载体LV和AAV,LV由于含有脂包膜结构一般都在生理盐条件下存在,而AAV在高盐条件下不易团聚、更稳定。而在生理盐浓度及更高浓度条件下,Benzonase活性受到抑制。
SANHQ(生物工艺级)是用Pichiapastoris表达的重组非特异性内切核酸酶,广泛应用于生产工艺流程中,有效去除核酸污染。该酶在高盐浓度下具有良好的活性,应用在生产工艺流程中提高去除效率和目标产物产量。在生物制品生产,如AAV载体及腺病毒载体疫苗生产中,宿主细胞DNA残留是关键质量参数之一。宿主细胞DNA主要以染色质形态存在,其中的组蛋白通过离子相互作用及疏水相互作用与DNA紧密结合,从而影响DNA的检测与酶切处理。SAN HQ(生物工艺级)高盐核酸酶在生物制品生产,如AAV载体及腺病毒载体疫苗生产中,宿主细胞DNA残留是关键质量参数之一。
SANHQ(Bioprocessinggrade)是一种新型的、耐高盐的工程化内切酶。该酶在0.5MNaCl条件下具有良好活性,是大规模生产及生物工艺流程中去除核酸污染的理想选择。盐浓度是纯化工艺的重要参数之一,高盐浓度能够减少聚集、增加目标产物溶解度及提高目标产物产量。高盐浓度下,宿主DNA与蛋白质能够完全解离,从而更容易被降解。在药物(如抗体、病毒载体药物等)的生产及工艺流程中,核酸杂质的去除至关重要。US FDA指南要求:zhiliao用重组生物制品终产品中,核酸杂质含量低于100 pg/dose。SAN HQ独特的耐高盐特性、合规的生产体系标准,让其成为大规模生产工艺中核酸处理的理想选择。SAN HQ高盐核酸酶有两个级别,分别是生物工艺级别SAN HQ和GMP级别SAN HQ GMP。浙江ArcticZymes高盐核酸酶70921
使用Benzonase时,不能把载体表面的DNA去除彻底,因而不能阻止纯化的病毒载体聚集。青海ArcticZymes高盐核酸酶70921-150
Mayer等(2023)以measles virus(麻疹病毒,MV)为例,评估了四种不同核酸酶(BenzonaseTM、DeneraseTM、M-SAN HQ中盐核酸酶及SAN HQ高盐核酸酶)对于染色质DNA去除的效果。Vero细胞通过微载体贴壁培养来生产麻疹病毒MV,72hr后收获上清液,使用3µm cellulose filter(Sartorius)过滤后分装多份,置于-80℃保存便于后续使用。在解冻后的上清中调节对应盐浓度,并加入50 U/ml核酸酶,37℃孵育2hr进行消化,消化后留样;将消化后上清液过Capto Core 700 (Cytiva)柱子,收集流穿液,之后洗杂、洗脱,并分别留样。通过SDS-PAGE分析发现,相比Benzonase等传统核酸酶,在生理盐条件下M-SAN HQ中盐核酸酶更高效将染色质DNA剪切成更小片段,甚至将核小体DNA剪切更彻底。青海ArcticZymes高盐核酸酶70921-150
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