与IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一种精氨酸特异性蛋白酶,可消化精氨酸残基的C末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化;在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶,可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基,包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽,胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择,以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性,通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性,它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。Genovis发现大部分缓冲液与FabRICATOR活性兼容,已经测试了PBS和150mM 醋酸铵 pH7,也适用于FabRICATOR HPLC。FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
与IdeS不同,度拉糖肽由两个胰高xue糖素样肽-1 (GLP-1) 分子组成,它们通过柔性 GS 接头连接到人 IgG4 的 Fc 区域。为了分别研究肽和 Fc 区域,从而鉴定结构域特异性 PTM,用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化度拉糖肽 1 小时。为了降低样品复杂性,使用内切糖苷酶GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖,并用DTT还原链间二硫键。反相LC-MS对样品的分析表明,使用GlySERIAS进行连接子消化后,肽从Fc区域完全去除。连接子中的大量甘氨酸残基为GlySERIAS提供了许多不同的潜在消化位点,这就是为什么Fc/2和GLP-1肽都被检测为几种变体,其中不同数量的甘氨酸和丝氨酸残基仍然连接。此外,还鉴定了GLP-1肽的氧化。尽管GlySERIAS同时在多个位点进行消化,但一式三份的酶解在获得的不同Fc/2变体的相对量中显示出可重复的结果。河南FabDELLOIdeS蛋白酶抗体酶切中级分析已成为分析单克隆抗体疗法的标准方法,并为产品质量属性提供特定领域的信息。
用于IgA1和IgA2m1以上铰链消化的冻干酶。与IdeS不同,Genovis提供的IgASAPSub1+2在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1和IgA2m1,产生完整且均匀的Fab和Fc片段。由于人IgA1的铰链比IgA2的铰链长,因此IgA1和IgA2m1之间来自消化位点的氨基酸C末端不同。IgASAPSub1+2可消化分泌物和血清IgA。孵育时间为过夜(16-18小时),并且由于酶的特异性,没有过度消化的风险。该酶在pH值为6.0至8.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可产生活性。活性为37°C。IgASAPSub1+2是从丹毒梭菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为131kDa。IgASAPSub1+2冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1和IgA2m1。
Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR(IdeS),为客户提供了许多选择,以满足他们的需求。 冻干形式用于高度灵活的方法开发的目的,并随时准备使用,只需重组和添加到IgG样本。 冻干酶的灵活性也意味着它可以应用于更高的通量和自动化的工作流程。 Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶,在随时可用的旋转柱中,这可以极大限度地减少在样品中残留的酶,这可能是有利的。 对于更多的制备应用,我们提供FabRICATOR Fab2试剂盒,这是IgG片段生成和纯化的强大工具。 这包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc纯化柱,用于亚基的亲和纯化。 由于FabRICATOR在非还原条件下是活性的,F(ab’)2片段保留其链间和链内二硫键,如果片段想用于结合研究,这一点尤为重要,因为结合效率和免疫反应性将被保留。该酶在pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性。
与IdeS不同,为了获得更均匀的度拉糖肽融合蛋白的消化产物,用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白质消化该蛋白质,该蛋白由与琼脂糖珠共价偶联的GlySERIAS酶组成。通过将酶偶联到树脂上,可以增加酶与蛋白质的比率,从而可以进一步加速反应,以获得更完整的连接子消化。此外,该酶不会存在于样品制备中,可能会干扰样品分析。为了进行比较,度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化过夜,或用GlySERIAS冻干1小时并在37°C下过夜消化。 为了降低样品复杂性,使用内切糖苷酶GlycINATOR冻干去除Fc聚糖,并减少链间二硫键。通过反相LC-MS对样品的分析表明,GlySERIAS Immobilized几乎完全消化了Fc结构域中的连接子,留下了接近均质的Fc/2产物,其中含有来自连接子的一个丝氨酸残基。用 GlySERIAS 冻干 1 小时或过夜消化,两者都会产生几种 Fc 产物,并附着不同数量的丝氨酸和甘氨酸残基。GLP-1肽在所有三个样品中以两种变体存在。使用GlySERIAS固定化消化的均质Fc/2能够详细研究特定于Fc区域的质量属性。此外,在样品中未观察到干扰分析的酶峰。作为补充,Fc/2 产物在用 GlySERIAS 冻干消化后残留部分连接子,有助于研究位于 GS 连接子的修饰。可以用Genovis的GlySERIAS固定化酶(琼脂糖珠共价偶联)消化度拉糖肽。云南IgGZEROIdeS蛋白酶抗体酶切
三个柔性 GS 连接子均被切开,这有助于识别Fc区域的修饰。FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
与IdeS不同,Romiplostim 由四个相同的血小板生成素 (TPO) 受体结合肽和一个 Fc 片段组成,通过柔性聚甘氨酸序列连接在一起。与度拉糖肽类似,用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下过夜,或用 GlySERIAS 冻干 1 小时并在 37°C 下过夜消化该蛋白质。 链间二硫键被还原,以便于通过反相LC-MS进行以下分析。与度拉糖肽的观察结果类似,用固定化酶消化产生均质的 Fc/2,剩下一个连接子残基,此处为甘氨酸残基。这有助于识别专门位于Fc区域的修改。用冻干酶消化 1 小时得到 Fc/2,剩余 4 个甘氨酸残基和少量的 Fc/2 仍与一个 TPO 肽连接。另一方面,这使得研究 Fc/2 和第yi个肽之间的连接区域成为可能,而不会受到第二个肽的干扰。用 GlySERIAS 冻干液过夜消化产生 2 个 Fc/2 变体,分别剩下 4 个和 1 个甘氨酸残基。根据消化时间的不同,使用冻干产物释放的肽以五或七种变体存在,接头中残留的甘氨酸残基数量不同,而使用固定化产物释放的肽以四种变体存在。FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学
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