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二代测序基本参数
  • 品牌
  • 嘉安健达
  • 型号
  • illumina novaseq6000
二代测序企业商机

二代测序不同应用场景下的速度有多快?

病原微生物检测:一般来说,二代测序用于检测病原微生物时,能够在几个小时到一天左右出结果。比如在快速检测血液中的病原微生物时,通常可以在几个小时内获得检测结果,相比传统的血液培养方法,时间大幅缩短,传统血液培养一般需要几天到一周的时间 。

全基因组测序:如果是对人类全基因组进行测序,以目前的技术水平,使用二代测序技术完成一个人的全基因组测序,一般需要 1-2 天左右的时间。而在十几年前,人类全基因组测序计划***完成时,耗费了大量的时间和精力,相比之下二代测序技术的速度提升***。

转录组测序:转录组测序的时间相对较短,一般几个小时内可以完成对大量 RNA 分子的测序和初步数据分析,进而快速了解基因在特定条件下的表达情况8. 二代测序的优势是高通量。南京二代测序技术

二代测序技术的一些***研究进展①

疾病诊断与***领域 :消化系统**标志物检测:2024 年的**共识指出,二代测序(NGS)技术可同时检测消化系统**中的多种标志物,如错配修复基因变异、微卫星不稳定性(MSI)状态、**突变负荷(TMB)等,为**的精细***提供了更***、准确的信息。例如,MSI-H 的实体瘤患者可使用帕博利珠单抗进行***,而 NGS 技术能更好地检测 MSI 状态及相关耐药机制。

**液体活检:通过检测血液中的循环** DNA(ctDNA)等标志物,实现对**的早期筛查、诊断和***监测。NGS 技术能够更敏感地检测到 ctDNA 中的基因突变和变异,为**的无创诊断提供了有力支持。


徐汇区嘉安健达二代测序价格二代测序的成本比一代测序高吗?

二代测序应用于蛋白组测序的常见方式②?

结合质谱技术的联合分析

原理:质谱技术是目前蛋白组学中鉴定和分析蛋白质的**技术。它可以将蛋白质酶解成肽段后进行离子化,然后根据不同肽段在质谱仪中的质荷比等特征来确定肽段的序列,进而推导出蛋白质的序列信息。二代测序在这里的作用是辅助质谱分析,比如对样本进行转录组测序,获得基因序列信息,帮助构建蛋白质序列数据库。当质谱检测到肽段后,可以基于这个参考数据库更精细地匹配和鉴定出对应的蛋白质,同时也有助于分析蛋白质的可变剪接产生的异构体等复杂情况。

应用案例:在**研究中,获取**组织和相邻正常组织样本。先通过二代测序构建该组织对应的转录组序列数据库,然后利用质谱分析**组织中的蛋白,借助之前构建的数据库,能够准确鉴定出许多在**中特异性表达或表达量发生***变化的蛋白质,进一步研究这些蛋白质在**发***展中的作用,像发现某些参与细胞信号转导通路的蛋白出现异常表达,可能与肿瘤细胞的增殖、转移等特性相关。

二代测序——RNA甲基化的概念、作用和检测方法

RNA 甲基化概念及位置:RNA 甲基化是在 RNA 分子上添加甲基基团,其中 N6 - 甲基腺苷(m6A)是最常见的一种 RNA 甲基化修饰形式,它主要发生在 mRNA(信使 RNA)的腺嘌呤(A)残基上。

作用

1、影响 RNA 的稳定性:m6A 修饰可以影响 mRNA 的稳定性。例如,一些带有 m6A 修饰的 mRNA 更容易被降解,从而调控基因表达的时间和水平。2、调节 RNA 的剪接和翻译:m6A 修饰还能够调节 mRNA 的剪接过程,影响不同转录本的生成。同时,它也可以在翻译水平上发挥作用,影响蛋白质合成的效率。

检测方法

甲基化 RNA 免疫沉淀测序(MeRIP - Seq):这种方法主要是利用特异性识别 m6A 修饰的抗体,对 RNA 进行免疫沉淀富集,然后通过高通量测序来鉴定 m6A 修饰的位点和水平。 单细胞测序属于二代测序吗?

二代测序在代谢组研究中的应用途径①

通过转录组测序关联代谢组

原理:转录组测序借助二代测序技术可以获取细胞或组织中所有mRNA的表达信息。由于基因表达**终会影响代谢过程,mRNA转录水平的变化往往会导致后续代谢途径中关键酶的表达改变,进而影响代谢物的合成与转化。例如,当某个参与糖代谢途径的关键酶基因转录上调时,对应的酶含量可能增加,从而加速该代谢途径的运转,使代谢产物的量也随之发生变化。

案例:在植物抗逆研究中,对遭受干旱胁迫的植物和正常生长的植物分别进行转录组测序。发现许多与渗透调节物质(如脯氨酸、甜菜碱等)合成相关的基因转录水平在干旱胁迫植株中显著提高。再结合对植物代谢组的分析,的确检测到脯氨酸、甜菜碱等代谢物的含量明显增多,表明植物通过调节基因转录来改变代谢,以适应干旱环境。


二代测序产出的数据量有多少?陕西哪里有二代测序

高通量测序是二代测序吗?南京二代测序技术

关于二代测序的简介:

二代测序技术(Next-Generation Seguencing,NGS)也称为高通量测序技术,是一种能够同时对数百万甚至数十亿个 DNA片段进行测序的方法。与传统的桑格测序相比二代测序技术具有高通量、高准确性、高灵敏度和低成本等优势。

二代测序技术在大幅提高了测序速度的同时,大幅度的降低了测序成本,保持了高准确性,以前完成一个人类基因组的测序需要3年时间,而使用二代测序技术则需要1周,但其序列读长方面比起一代测序技术则要短很多,大多只100bp-150bp。


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