Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用，但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游离N-糖以及去糖基化抗体的功能和结构。 为了证明PNGase F固定化和PNGase F冻干在天然反应条件下有效去除Fc N-聚糖，对zhiliao性抗体曲妥珠单抗进行了处理。图2中的质量数偏移表明，在37°C下用Genovis的PNGase F冻干或PNGase F固定化孵育1小时后，曲妥珠单抗上的Fc N-聚糖成功去除，与在溶液中用PNGase F冻干处理的样品相比，没有酶干扰用PNGase F固定处理的样品的分析。复杂样品的特异性净化；改进 MS 分析的样品制备。重庆瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
与PNGase F类似，Genvois的OmniGLYZOR用于携带N-和简单O-糖的糖蛋白的去糖基化。 OmniGLYZOR 试剂盒包括：OmniGlyZOR 微离心柱；PNGase F 冻干；RapiGest™* SF表面活性剂。除非底物蛋白变性，否则某些 N-糖基化位点很难或无法被 PNGase F 接近。在OmniGLYZOR Microspin柱上孵育后剩余的N-糖可以在变性条件下使用试剂盒中包含的PNGase F冻干和RapiGest™ SF表面活性剂通过额外的去糖基化步骤去除。使用Genovis的OpeRAT对EPO进行O-糖位点特异性消化：对于jin携带一个或几个 O-糖基化位点的简单底物蛋白，OpeRATOR 也可用于绘制中间水平的 O-糖基化位点。 河北瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶使用OpeRATOR对胞生成素（EPO）进行O-糖位点特异性消化：确定中级水平的 O-糖基化位点。
Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。
在Genovis的PNGaseF去除N-聚糖并用SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后，在质谱图中观察到几个与GalNAcs相关的峰。为了去除剩余的GalNAc残基，应用GalNAcEXO酶。用GalNAcEXO处理后观察到的单个蛋白峰显示完全去除剩余的GalNAcs。 GalNAcEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性，使其与大多数样品相容。此外，GalNAcEXO的活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子，如BSA。根据底物的性质，糖蛋白的GalNAcEXO反应在2小时内完成，而更复杂的样品可能需要孵育过夜。Genovis的GalNAcEXO也可固定在离心柱中，以便快速方便地处理样品，在制备过程中不会残留酶。现O-糖基化药有Tn抗原，定量he心 GalNAc 水平，减少了异质性。
Genovis的SialEXO固定化用于复杂糖蛋白的去唾液酸化：在设置反应条件时，需要在所需的反应时间和完成反应所需的酶量之间进行权衡。较高的酶量可保证在更短的时间内完成周转，但会使下游分析复杂化。为了避免此类问题，我们以离心柱形式固定了活性SialEXO。这允许以更短的孵育时间孵育具有明显更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。这种糖蛋白是一种具有挑战性的底物，具有 6 个 N- 和多达 26 个 O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 连接的唾液酸修饰。对游离的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化，SialEXO固定化。而不会用酶污染z终制剂，可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。河南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
评价抗体片段对完整蛋白聚集的影响：可使用Genovis的IgdE酶（FabALACTICA®）和PNGaseF酶。重庆瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖：Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性，这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中，例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟，并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解，这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。重庆瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
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